Luigi Ricciardi 1 , Rosa Mazzeo 2,*©, Angelo Raffaele Marcotrigiano 1 , Guglielmo Rainaldi 3 , Paolo Iovieno 4 , Vito Zono 1 , Stefano Pavan Ọdun 1© ati Concetta Lotti 2,*
- 1 Sakaani ti Ile, Ohun ọgbin ati Awọn Imọ-jinlẹ Ounjẹ, Awọn Jiini Ohun ọgbin ati Ẹka Ibisi Yunifasiti ti Bari, Nipasẹ Amendola 165/A, 70125 Bari, Italy; luigi.ricciardi@uniba.it (LR);angelo.marcotrigiano@uniba.it (ARM); vito.zonno@uniba.it (VZ); stefano.pavan@uniba.it (SP)
- 2 Ẹka ti Awọn sáyẹnsì ti Agriculture, Ounjẹ ati Ayika, University of Foggia, Nipasẹ Napoli 25, 71122 Foggia, Italy
- 3 Ẹka ti Biosciences, Biotechnologies ati Biopharmaceuticals, University of Bari, Nipasẹ Orabona 4, 70125 Bari, Italy; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 Ẹka Awọn Imọ-ẹrọ Agbara, Bioenergy, Biorefinery ati Green Chemistry Division, ENEA Trisaia Iwadi ile-iṣẹ, SS 106 Ionica, km 419 + 500, 75026 Rotondella (MT), Italy; paolo.iovieno@enea.it
* Ifiroṣe: rosa.mazzeo@unifg.it (RM); concetta.lotti@unifg.it (CL)
áljẹbrà:
Alubosa (Allium cepa L.) jẹ irugbin elewe pataki keji julọ ni agbaye ati pe a mọrírì pupọ fun awọn anfani ilera rẹ. Pelu pataki eto-aje pataki rẹ ati iye rẹ bi ounjẹ iṣẹ ṣiṣe, alubosa ko ti ṣe iwadii daradara pẹlu ọwọ si oniruuru jiini. Ninu eyi, a ṣe iwadi lori iyatọ jiini ni "Alubosa pupa Acquaviva" (ARO), ilẹ-ije kan ti o ni itan-ogbin ti ọgọrun ọdun ni ilu kekere kan ni agbegbe ti Bari (Apulia, Gusu ti Italy). Eto ti awọn ami ami microsatellite 11 ni a lo lati ṣawari iyatọ jiini ninu akojọpọ germplasm kan ti o ni awọn olugbe ARO 13 ati awọn iru iṣowo ti o wọpọ mẹta. Awọn itupalẹ ti igbekalẹ jiini pẹlu awọn ọna parametric ati ti kii ṣe parametric ṣe afihan pe ARO duro fun adagun jiini ti o ni asọye daradara, ti o han gbangba ti o yatọ si Tropea ati Montoro landraces pẹlu eyiti o jẹ aṣiṣe nigbagbogbo. Lati le pese apejuwe ti awọn isusu, ti a lo nigbagbogbo fun agbara titun, akoonu ti o ni agbara ti o yo ati pungency ni a ṣe ayẹwo, ti o nfihan adun ti o ga julọ ni ARO pẹlu ọwọ si awọn ilẹ-ilẹ meji ti a mẹnuba loke. Iwoye, iwadi ti o wa lọwọlọwọ jẹ iwulo fun isọdọtun ọjọ iwaju ti ARO, eyiti o le ni igbega nipasẹ awọn aami didara eyiti o le ṣe alabapin si idinwo awọn arekereke iṣowo ati ilọsiwaju owo-wiwọle ti awọn oniwun kekere.
ifihan
Iwin Allium pẹlu bii 750 eya [1], laarin eyiti alubosa (Allium cepa L., 2n = 2x = 16) jẹ ọkan ninu eyiti o tan kaakiri julọ. A. cepa ni o ni a biennial ọmọ ati ki o kọja awọn iwa ibisi. Ni ode oni, iṣelọpọ alubosa agbaye (97.9 Mt) jẹ ki o jẹ irugbin ẹfọ keji ti o ṣe pataki julọ lẹhin tomati [2]. Lati igba atijọ, awọn isusu alubosa ti lo mejeeji bi ounjẹ ati ni awọn ohun elo oogun eniyan. Nitootọ, awọn ara Egipti atijọ ti royin ọpọlọpọ awọn ilana itọju ailera ti o da lori lilo ata ilẹ ati alubosa ni papyrus iṣoogun ti 1550 BC, Codex Ebers [3].
Ewebe ti o wapọ ati ilera jẹ aise, titun, tabi bi ọja ti a ti ni ilọsiwaju, ati lilo lati jẹki itọwo ti ọpọlọpọ awọn ounjẹ. Ọpọlọpọ awọn ijinlẹ aipẹ beere pe lilo alubosa le dinku eewu awọn arun inu ọkan ati ẹjẹ [4,5], isanraju [6], diabetes [7], ati awọn ọna oriṣiriṣi ti akàn [8-10]. Awọn ohun-ini ilera alubosa nigbagbogbo ni a da si awọn ipele giga ti awọn kilasi meji ti awọn agbo ogun nutraceutical: flavonoids ati alk (en) yl cysteine sulphoxides (ACSOs). Kilasi akọkọ pẹlu flavonols ati anthocyanins. Quercetin jẹ flavonol ti o ṣe iwari akọkọ, ti a mọ fun ẹda ara-ara ti o lagbara ati awọn ohun-ini egboogi-iredodo ni isọdọtun radical ọfẹ ati isopọ awọn ions irin iyipada. [11]; nigbati awọn anthocyanins funni ni awọ pupa / eleyi ti si diẹ ninu awọn oriṣiriṣi alubosa. Fun awọn ACSO, lọpọlọpọ julọ ni isoalliin [(+) -trans-S-1-propenyl-L-cysteine sulfoxide] [12], amino acid ti kii ṣe iyipada ati ti kii-proteinogenic imi-ọjọ ti a fipamọ sinu awọn sẹẹli, eyiti o jẹ iduro taara fun oorun oorun ati itọwo alubosa. [13]. Lori idalọwọduro ti ara, isoalliin ti pin nipasẹ ensaemusi alliinase lati ṣe agbejade lẹsẹsẹ awọn agbo ogun ti o le yipada (pyruvate, amonia, thiosulphonates ati propanethial S-oxide) eyiti o fa yiya ti o si fa õrùn aibikita (pungency) [14]. Pungency alubosa nigbagbogbo ni iwọn bi iye, fun giramu ti iwuwo titun, ti pyruvic acid ti ipilẹṣẹ nipasẹ hydrolysis [15,16].
Ni awọn orilẹ-ede ti Mẹditarenia agbada, dabaa bi ọkan ninu awọn Atẹle oniruuru awọn ile-iṣẹ ti A. apa [17,18], Awọn isusu alubosa ṣe afihan iyipada nla ni apẹrẹ, iwọn, awọ, ọrọ gbigbẹ, ati pungency [19-22]. Pẹlupẹlu, idapọ ti o da lori imi-ọjọ, awọn iṣe agronomic, iru ile, awọn ipo oju-ọjọ, ati genotype ti cultivars tabi landraces le ni ipa lori didara boolubu nipasẹ fifun awọn iye-ara organoleptic pataki ati ijẹẹmu [23-27]. Ni Ilu Italia, laibikita wiwa germplasm alubosa jakejado, awọn oriṣi alubosa diẹ ni igbagbogbo ni a tẹriba si awọn iwadii imọ-jinlẹ ati ti ṣe afihan daradara. [28,29].
Jiini ni kikun ati ijuwe ẹda agro-oniruuru jẹ pataki lati ṣe idaniloju itọju ti o yẹ ti awọn orisun jiini ọgbin ati igbega lilo awọn genotypes kan pato ninu pq iye. [30-32]. Awọn asami ti o rọrun atunwi (SSR) ni a ti yan nigbagbogbo fun ṣiṣe aworan [33-35], DNA fingerprinting ati cultivar iyasoto [36-38], ati idiyele igbẹkẹle ti iyatọ jiini laarin ati laarin awọn eya ilẹ [39-42], niwọn bi wọn ti jẹ agbegbe kan pato, olona-allelic, jogun codominantly, ṣe atunṣe pupọ, ati pe o dara fun adaṣe adaṣe.
Ninu iwadi ti o wa lọwọlọwọ, a dojukọ akiyesi wa lori ilẹ-ibile aṣa Apulian kan, "Alubosa pupa Acquaviva" (ARO), eyiti a gbin ni ibamu si awọn ọna ogbin Organic ni agbegbe kekere ti ilu Acquaviva delle Fonti, ni agbegbe ti Bari. (Apulia, Gusu Italy). Awọn isusu ti ilẹ-ilẹ yii tobi ati fifẹ ati awọ pupa ati pe wọn lo pupọ julọ ni awọn ilana agbegbe. Botilẹjẹpe ARO ni ami ami didara “Presidium Ounjẹ ti o lọra”, iṣelọpọ rẹ le ni igbega siwaju ati aabo nipasẹ awọn ami didara ti European Union gẹgẹbi itọkasi agbegbe ti o ni aabo (PGI) ati yiyan iyasọtọ ti ipilẹṣẹ (POD), nitori iwọnyi le ṣe alabapin si idinwo owo frauds ati ki o mu awọn owo oya ti smallholders. Ninu eyi, awọn asami molikula SSR ni a lo bi awọn irinṣẹ agbara lati ṣe ayẹwo iyatọ jiini laarin awọn olugbe ARO ati lati ṣe iyatọ si ilẹ-ilẹ yii lati awọn ere ilẹ alubosa pupa Gusu Gusu meji miiran. Pẹlupẹlu, a ṣe iṣiro pungency ati akoonu to lagbara lati le ṣe iṣiro adun ARO ni ibatan pẹlu ibeere ọja naa.
awọn esi
Idasile ti Acquaviva Red Alubosa Germplasm Gbigba ati Morphological Characterization
Irugbin ti 13 olugbe ti ARO landrace, itọrẹ nipasẹ awọn agbe ni ilana ti BiodiverSO Apulia Region ise agbese won lo lati fi idi kan ARO germplasm gbigba.
Awọn apejuwe Morphological, ti o ni ibatan si boolubu, awọ ara, ati ẹran ara ni a kojọ lori germplasm ARO ati lori awọn ilẹ alubosa mẹta, meji ti o jẹ ti “alubosa pupa Tropea” (TRO) ilẹ ati ọkan si “alubosa Ejò Montoro” (MCO) landrace (Figure). 1). Gbogbo awọn gilobu ARO jẹ alapin ati pe wọn ṣe afihan nipasẹ awọ ita pupa ati ẹran ara pẹlu awọn ojiji oriṣiriṣi ti pupa. Ni ifiwera, ẹran ara ti awọn isusu TRO jẹ pupa ni kikun, lakoko ti ẹran-ara ti awọn isusu MCO ko ni awọ ti ko dara (Table S1). Onínọmbà Biokemika gba ọ laaye lati ṣe iṣiro akoonu ti o fẹsẹmulẹ ti o lagbara ati pungency. Bi royin ninu Table 1, awọn iye-itumọ ti akoonu ti o fẹsẹmulẹ ti awọn isusu ni awọn olugbe ARO jẹ 7.60, ati pe o wa lati 6.00 (ARO12) si 9.50° Brix (ARO11 ati ARO13). Iye yii ga ju eyi ti a pinnu fun TRO ati MCO landraces (4.25 ati 6.00° Brix, lẹsẹsẹ).
Table 1. Akoonu Soluble ati Awọn iye Pungency Ti a ṣe ayẹwo ni “Acquaviva Red Alubosa” (ARO), “Tropea Red Alubosa” (TRO), ati “Montoro Copper Alubosa” (MCO) Olugbe *.
CODE | Akoonu Ri to Soluble (Brix) | Pungency (pmolg-1 FW) | ||
Itumo | CV y (%) | Itumo | CV y (%) | |
ARO1 | 6.25 D * | 5.65 | 5.84 ab * | 23.78 |
ARO2 | 7.25 DC | 4.87 | 6.51 to | 22.98 |
ARO3 | 7.50 BCD | 9.42 | 5.28 ab | 22.88 |
ARO4 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.97 to | 3.74 |
ARO 5 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.80 to | 9.68 |
ARO6 | 6.25 D | 5.65 | 4.51 ab | 39.18 |
ARO7 | 7.25 DC | 4.87 | 5.25 ab | 15.44 |
ARO8 | 9.00 AB | 0.00 | 7.04 to | 3.49 |
ARO9 | 8.25 ABC | 4.28 | 6.84 to | 0.15 |
ARO10 | 7.00 DC | 0.00 | 5.94 ab | 6.57 |
ARO11 | A 9.50 | 7.44 | 5.54 ab | 16.43 |
ARO12 | 6.00 D | 0.00 | 4.91 ab | 9.70 |
ARO13 | A 9.50 | 7.44 | 6.63 to | 24.93 |
MCO | 6.00 D | 0.00 | 4.18 ab | 2.66 |
TRO1 | 4.25 E | 8.31 | 2.80 b? | 2.10 |
TRO2 | 4.25 E | 8.31 | 4.28 ab | 4.79 |
* Itumọ pẹlu awọn lẹta kanna ni oke nla tabi kekere ko yatọ ni iṣiro ni 0.01P tabi 0.05P, lẹsẹsẹ (idanwo SNK). y olùsọdipúpọ ti iyatọ.
Iwọn apapọ ti pungency ARO, ti a ṣe ayẹwo nipasẹ ọna ti akoonu pyruvic acid, jẹ 6.00, ti o wa lati 4.51 pmol g-1 FW (ARO6) si 7.04 (ARO8). Iye yii ga ju eyi ti a ṣero ni TRO ati MCO landraces (3.54 pmol g-1 FW ati 4.18 pmol g-1 FW, lẹsẹsẹ).
SSR Polymorphism ati Awọn ibatan Jiini laarin Awọn ẹya
Ninu iwadi ti o wa lọwọlọwọ, 11 ninu 37 idanwo awọn akojọpọ alakoko SSR ti pese awọn polymorphisms-ipo kan, ie, ti nso ni julọ awọn ọja imudara meji ni ẹyọkan. Iwoye, 55 alleles ni a rii ni awọn ẹni-kọọkan 320 pẹlu nọmba awọn alleles fun agbegbe ti o wa lati 2 (ACM147 ati ACM 504) si 11 (ACM132) ati iye iye ti 5 alleles (Table). 2). Ninu awọn eniyan kọọkan, nọmba alleles (Na) wa lati 1.94 (ACM147 ati ACM504) si 5.38 (ACM132), lakoko ti nọmba ti o munadoko ti alleles (Ne) wa lati 1.41 (ACM152) si 2.82 (ACM449). Iyato laarin Na ati Ne iye wà nitori niwaju alleles pẹlu kekere igbohunsafẹfẹ ninu awọn olugbe ati awọn predominance ti nikan kan diẹ alleles. Iwọn heterozygosity (Ho) ti o ga julọ ni afihan fun ACM138 ati ACM449 (0.62), lakoko ti o kere julọ ni nkan ṣe pẹlu ACM152 (0.25). heterozygosity ti a ti ṣe yẹ (He), eyiti o ni ibamu si ireti imọ-jinlẹ ni olugbe panmictic, ti o wa lati 0.37 (ACM504) si 0.61 (ACM132, ACM138, ati ACM449). Atọka imuduro Wright (Fis), awọn iye ifihan ti o sunmọ odo (apapọ 0.05) fun gbogbo awọn asami, nfihan awọn iye ti o jọra laarin awọn ipele heterozygosity ti a ṣe akiyesi ati ti a nireti, bi o ti ṣe yẹ fun eya ti o kọja. Iṣiṣẹ ti asami SSR kọọkan ni titẹ ika jiini jẹ iṣiro nipasẹ itọka alaye alaye polymorphic (PIC), pẹlu iye iwọn 0.48 ati larin lati 0.33 (ACM504) si 0.67 (ACM132). Atọka iṣẹ ṣiṣe miiran, Atọka Alaye ti Shannon (I) ṣe afihan iye apapọ ti 0.84, ati pe awọn iye ti a pinnu lati 0.45 (ACM152) si 1.20 (ACM132).
Table 2. Awọn ẹya Polymorphism ti 11 Awọn asami SSR ti a lo lati ṣe iṣiro Oniruuru Jiini ni ARO, TRO, ati Awọn olugbe MCO. Nọmba Apapọ ti Alleles (Na), Iwọn Iwọn Band, ati Akoonu Alaye Polymorphic (PIC) Tọkasi Apapọ Eto ti Awọn Olukuluku 320 Genotyped ninu Ikẹkọ yii. Nọmba ti Alleles (Na), nọmba ti Alleles Munadoko (Ne), Ti ṣe akiyesi Heterozygosity (Ho), Heterozygosity ti a nireti (He), Atọka Fixation (Fis), ati Atọka Alaye ti Shannon (I) tọka si Awọn iye Itumọ Ti a ṣe iṣiro lati ọdọ Olugbe 16, Ọkọọkan Ti a kọ nipasẹ Awọn Olukuluku 20.
Locus. | Lapapọ Na | Iwọn Iwọn (bp) | omiiran | Itumo | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
Itumo | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
Lara awọn olugbe, ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1, ati MCO ṣe afihan ipele giga ti iyatọ jiini (Ho> 0.5), lakoko ti a ṣe akiyesi iyatọ ti o kere julọ ninu olugbe ARO7 (Ho = 0.27) (Tabili S2). Lapapọ, gbogbo awọn ẹya ti o han Fis awọn iye to sunmo odo (Fis iye tumọ = 0.054), bi o ti ṣe yẹ labẹ awọn ipo ibarasun laileto.
Itupalẹ Iyatọ Molecular ati Eto Jiini
Pipin akosori ti iyatọ jiini laarin ati laarin awọn olugbe jẹ iṣiro nipasẹ AMOVA. Awọn abajade ṣe afihan ida pupọ ti iyatọ jiini laarin awọn olugbe (87%). Iyatọ laarin awọn olugbe, 13%, ṣe pataki pupọ (P <0.001) (Tabili 3). Awọn iye meji ti paramita Fpt, afọwọṣe ti atọka imuduro Wright's Fst, ti o wa lati 0.002 (ARO2/ARO10) si 0.468 (ARO7/TRO2), ṣe pataki (AROXNUMX/TROXNUMX).P <0.05), ayafi fun awọn afiwera mẹsan-meji (Afikun Tabili S3).
Table 3. Onínọmbà ti Iyatọ Molecular ti 320 Genotypes lati 16 Olugbe ti allium cepa L.
orisun | df | Akopọ ti onigun | Iṣiro Iyatọ | Iyatọ (%) | Fpt | P |
Lara awọn olugbe | 15 | 458.63 | 1.16 | 13% | ||
Laarin awọn olugbe | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87% | 0.134 | 0.001 |
Total | 319 | 2731.62 | 8.66 |
Iwadi ti jiini be ninu awọn A. apa ikojọpọ genotyped ninu iwadi yii ni a ṣe nipasẹ ọna itupalẹ akojọpọ orisun awoṣe admixture ti a ṣe imuse ni ẸRỌ sọfitiwia. Ọna Evanno AK daba ipinpin si awọn iṣupọ meji (K = 2) bi alaye julọ fun wa iwe data,pẹlu the Itele ti o ga julọoke ni K = 5 (sopplementaiv Rgure S1). A fun K = 2, ahpopawon ohun were kẹtẹkẹtẹigned si onati awọnf awọn iṣupọ meji pẹlu olùsọdipúpọ rnernbertoip (q)> 0.7. Gẹgẹ bi shown sinu olusin 2a, iṣupọ akọkọ (ti a npè ni S1) pẹlu MCO ati gbogbo awọn olugbe ARO, lakoko ti iṣupọ S2 ṣe akojọpọ awọn olugbe TRO meji. Ni K = 5, n pese apejuwe ti o jinlẹ ti dataset (Eyaworan 2b), 75% ti awọn ẹya ni a yàn si ọkan ninu iṣupọ marun. Iyapa laarin ARO (S1) ati TRO (S2) ni a fi idi mulẹ, botilẹjẹpe diẹ ninu awọn olugbe ARO ni a dapọ (q <0.7) tabi ṣe akojọpọ lọtọ ni awọn iṣupọ tuntun meji S3 ati S4 (ARO7 ati ARO12, lẹsẹsẹ). O yanilenu, iru iṣowo MCO ṣe agbekalẹ iṣupọ kan pato (S5) ti o yapa lati alubosa pupa Apulian.
Awọn ibatan Jiini laarin Awọn eniyan
SSR polymorphism gba ọ laaye lati fa dendrogram kan ti oniruuru jiini ati awọn abajade ti itupalẹ phylogenetic ti han ni Nọmba 3a. Nibi, ikojọpọ germplasm ti pin si awọn ẹgbẹ marun ni atilẹyin ni agbara nipasẹ awọn iye bata bata. Awọn olugbe ARO7 ati ARO12 ni a ya sọtọ lẹsẹkẹsẹ lati awọn olugbe to ku ati ṣe agbekalẹ awọn iṣupọ ọtọtọ meji. Iṣupọ kẹta pẹlu awọn olugbe iṣowo meji ti TRO, lakoko ti apa kẹrin pin MCO lati awọn olugbe ARO mọkanla. Ibasepo jiini ti o waye laarin awọn olugbe ni a ṣe iwadii siwaju nipasẹ ọna itupalẹ ipoidojuko akọkọ (PCoA) (Eyaworan 3b). Gẹgẹbi a ti ṣe afihan tẹlẹ, awọn eniyan ARO ni a ṣe akojọpọ ni wiwọ, ayafi fun ARO12 ati ARO7, eyiti o han ni awọn ipo ti o ya sọtọ ni idite PCoA. Awọn TRO meji ati awọn olugbe MCO ti tuka ni apa ọtun-isalẹ ti idite naa.
Ṣe nọmba 3. Oniruuru jiini laarin 16 A. apa awọn olugbe ti a ṣe afihan ninu iwadi yii, da lori profaili SSR wọn. (a) UPGMA dendrogram ti ijinna jiini. Awọn iye atilẹyin Bootstrap> 50 jẹ itọkasi loke awọn apa ti o baamu; (b) itupalẹ paati akọkọ (PCoA). Iṣupọ ti o yika ni pupa ni kikun baamu pẹlu ẹgbẹ ti ipilẹṣẹ nipasẹ itupalẹ phylogenetic ati ti o jẹ nipasẹ awọn ẹya ARO 11.
fanfa
Laarin iye nla ti agro-oniruuru-ara ti aṣa ti a gbin ni Gusu Ilu Italia, awọn ere ilẹ alubosa jẹ aṣoju awọn ọja onakan ti o nilo lati dabo kuro ninu eewu ogbara jiini ati irokeke rirọpo nipasẹ awọn cultivars ode oni. Ninu ilana ti iṣẹ akanṣe agbegbe BiodiverSO, ti o ni ero lati ṣajọ, ṣe afihan, igbega, ati aabo awọn orisun jiini ti agbegbe Apulia ti o ni asopọ lagbara si ohun-ini agbegbe, a ṣeto ikojọpọ irugbin ti awọn olugbe 13 ti ilẹ-ilẹ ARO. A ṣe ijabọ igbelewọn akọkọ ti iyatọ ARO ni awọn ofin ti DNA polymorphisms ati awọn aye kemikali meji, awọn ohun elo ti o soluble ati awọn akoonu inu pyruvic acid, ti o ni ibatan si awọn abuda adun ati ti pataki fun gbigba awọn ọja ti a ko jinna tuntun. Ni afikun, data lori ilẹ-ije ARO ni a fiwera pẹlu awọn ti a gba lori awọn ere-ilẹ alubosa awọ meji miiran ti o jẹ aṣiṣe nigbagbogbo.
Awọn itupalẹ biokemika ṣe afihan adun ti awọn olugbe ARO 13, ti o ni ibatan si akoonu ti o lagbara tiotuka giga ati pungency alabọde, ni ibamu si awọn itọsọna ile-iṣẹ alubosa didùn [31]. Awọn gilobu ARO dun ju awọn ti TRO ati MCO landraces, ati ki o han kan die-die ti o ga pungency. Bibẹẹkọ, didùn ninu alubosa jẹ nitori iwọntunwọnsi laarin akoonu suga ati pungency, nitorinaa ijuwe yii le wulo lati ṣe atilẹyin yiyan ti awọn genotypes ti iye, nigbagbogbo ti a ṣe nipasẹ awọn agbe nikan da lori mofoloji.
Awọn asami SSR ni a fi idi rẹ mulẹ pe o jẹ ohun elo ti o wulo lati ṣe iyasọtọ awọn genotypes, botilẹjẹpe a gba laarin agbegbe ti ndagba dín gẹgẹbi ilu Acquaviva delle Fonti. Awọn asami ti a yan ṣe afihan nọmba ti o ga julọ ti alleles ju awọn asami ti a royin tẹlẹ nipasẹ [43] ati [44], ṣugbọn kekere ju awọn asami royin nipa [45]. Pẹlupẹlu, 50% ti ṣeto awọn ami-ami wa fihan awọn iye atọka PIC ti o tobi ju 0.5 lọ, ti n fihan pe o dara lati ṣe iyatọ awọn olugbe inu ikojọpọ, bi a ti daba nipasẹ [46]. Igbelewọn oniruuru laarin awọn olugbe ṣe afihan awọn iye ti o jọra laarin Ho ati He, ti o yọrisi Fi kekeres awọn iye. Eleyi jẹ ni adehun pẹlu awọn jade-Líla iseda ti A. gba, eyi ti isẹ jiya lati inbreeding şuga [47]. Iwọn apapọ Fis iye ti a ṣe iṣiro ni awọn olugbe alubosa ti a gbero ninu iwadi yii (0.054) kere ju eyiti eyiti a royin tẹlẹ nipasẹ [45] (0.22) ati ki o fere aami si awọn ọkan ri nipa [31] (0.08) ati [48] (0.00) ti o ṣe ayẹwo oniruuru jiini ni awọn ilẹ alubosa lati ariwa iwọ-oorun Spain ati Niger, lẹsẹsẹ. Awọn ipele ti o ṣe akiyesi ti heterozygosity ni awọn olugbe ARO ṣe afihan imọran pe Apulia duro fun ile-iṣẹ oniruuru fun ọpọlọpọ awọn eya horticultural [32, 42, 49-51].
AMOVA ṣe afihan pe pupọ julọ iyatọ molikula ninu ikojọpọ genotyped ninu iwadi yii wa laarin awọn olugbe. Sibẹsibẹ, iyatọ jiini pataki laarin awọn olugbe (FPT iye) fi han iṣẹlẹ ti jiini stratification. Ni otitọ, botilẹjẹpe awọn abajade wa tọka wiwa isokan jiini ni ọpọlọpọ awọn olugbe ARO, ti o ṣẹda iṣupọ asọye daradara, awọn olugbe ARO7 ati ARO12 ṣe afihan profaili jiini pato ti o han gbangba. Abajade yii le jẹ nitori orisun ti o yatọ ti awọn irugbin ti awọn agbe meji lo lati eyiti a ti gba awọn olugbe. Pẹlupẹlu, da lori awọn abajade ti o gba, ARO landrace ni a le kà ni pato ni pato ni ipele jiini lati awọn ilẹ TRO ati MCO. Ninu iwadi kan laipe, [29] ṣe ayẹwo oniruuru jiini ti ọpọlọpọ awọn ilẹ alubosa Ilu Italia pẹlu “Acquaviva,” “Tropea,” ati “Montoro.” Botilẹjẹpe awọn onkọwe lo awọn ami ami SNP lati ṣe ayẹwo iyatọ jiini ti gbigba alubosa ti o gbooro, genotyping ko ni anfani lati ṣe iyasọtọ “Acquaviva” lati “Tropea” ati alubosa “Montoro”. Boya, aiṣedeede yii jẹ nitori iwọn kekere PIC ti a rii (0.292), ni iyanju iwifun gbogbogbo ti iwọntunwọnsi ti loci labẹ itupalẹ bi a ti sọ nipasẹ [29]. Pẹlupẹlu, lati le ṣe iwadii wiwa ti ipilẹ-ipilẹ ninu iṣupọ Itali wọn, yoo ti dara julọ lati ṣe itupalẹ awọn genotypes Ilu Italia lọtọ lati iyoku ikojọpọ naa. Boya yoo ti gba ọ laaye lati wo apẹrẹ ti oniruuru jiini ti o sopọ mọ isọdi-ilẹ tabi awọn abuda labẹ yiyan agbara.
Ni ipari, iwadi ti o wa lọwọlọwọ ṣe aṣoju ijabọ pipe lori ilẹ-ilẹ alubosa ti o ni nkan ṣe pẹlu ohun-ini aṣa agbegbe ati pataki ti ọrọ-aje fun awọn agbe. Awọn abajade wa ṣe afihan pe, pẹlu awọn imukuro diẹ, ARO jẹ ijuwe nipasẹ adagun-jiini ti o ni asọye daradara, eyiti o yẹ lati daabobo lati ewu ti ogbara jiini. Nitorina, idasile akojọpọ aṣoju ti orisun ti o niyelori ti oniruuru jiini ti jẹ pataki. Lakotan, jiini ati ijuwe phenotypic ti ARO le wulo lati gba awọn ami didara lati European Union.
Awon nkan ise nkan ati awon ona lati se nkan
Gbigba Germplasm, Ohun elo ọgbin, ati isediwon DNA
Eto ti awọn olugbe 13 ti ilẹ-ilẹ ARO ni a gba laarin ilana ti iṣẹ akanṣe Agbegbe Apulia kan (BiodiverSO: https://www.biodiversitapuglia.it/), nipasẹ ọpọlọpọ awọn iṣẹ apinfunni ti a ṣe ni "Acquaviva delle Fonti", ilu kekere Apulian ni Agbegbe ti Bari, Italy. Awọn aaye ikojọpọ ti awọn ẹya kọọkan ni a ya aworan nipasẹ Eto Alaye Agbegbe (GIS) ati royin ninu Tabili 4. Ni afikun, awọn eniyan meji lati TRO landrace ati ọkan olugbe lati MCO landrace ni o wa ninu iwadi ti o wa bayi ati lilo bi awọn itọkasi. Gbogbo awọn ohun elo ọgbin ni a dagba ni awọn ipo ayika kanna ni r'oko esiperimenta “P Martucci” ti Yunifasiti ti Bari (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E), labẹ agọ ẹyẹ aabo lati yago fun isodipupo agbelebu laarin awọn olugbe ati idaniloju ifasilẹ awọn eniyan inu-olugbe nipasẹ awọn fifun afẹfẹ (Lucilia Caesar). Awọn olugbe 16 ni a ṣe afihan fun awọn abuda ti o ni ibatan si iwọn boolubu ati apẹrẹ ati awọ ara ati awọ ara (Table S1). Ni afikun, a ṣe ayẹwo ayẹwo akoonu ti o lagbara ni lilo refractometer ti a fi ọwọ mu ati pe a ṣe iwọn pungency ni awọn ayẹwo oje alubosa fifi 2,4-dinitrophenyl hydrazine (0.125%) v/v ni 2N ti HCl) ati igbelewọn gbigba ni 420 nm, bi a ti royin nipasẹ [31]. Idanwo iwọn-pupọ ti Duncan ati idanwo SNK ni a ṣe lati pinnu wiwa awọn iyatọ pataki.
Table 4. Atokọ Awọn eniyan ti a kojọ ati Genotyped ninu Ikẹkọ yii. Fun Olukuluku Olukuluku, Koodu Idanimọ, Orukọ Agbegbe, Ipoidojuko GPS, ati Ile-ifowopamọ Gene Tọju Awọn irugbin jẹ Iroyin.
Code | Name | Awọn Alakoso GPS | Gene Bank y |
ARO1 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | Di.SSPA |
ARO2 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | Di.SSPA |
ARO3 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | Di.SSPA |
ARO4 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | Di.SSPA |
ARO5 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | Di.SSPA |
ARO6 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | Di.SSPA |
ARO7 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | Di.SSPA |
ARO8 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | Di.SSPA |
ARO9 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54'51.372″ N 16°49'3.504" E | Di.SSPA |
ARO10 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | Di.SSPA |
ARO11 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52'49.8″ N 16°49'48.575" E | Di.SSPA |
ARO12 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | Di.SSPA |
ARO13 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | Di.SSPA |
TRO1 | Cipolla rossa lunga di Tropea | - | Di.SSPA |
TRO2 | Cipolla rossa tonda di Tropea | - | Di.SSPA |
MCO | Cipolla Ramata di Montoro | - | Di.SSPA |
y Di.SSPA, Ẹka Ile, Ọgbin ati Awọn Imọ-jinlẹ Ounjẹ, University of Bari. |
Awọn ohun elo ewe ti 20 genotypes fun olugbe ni a ṣe ayẹwo ati fipamọ ni -80 °C titi lilo. Fun polysaccharide-ọlọrọ eya, bi A. gba, Awọn igbesẹ akọkọ yiyọ polysaccharide jẹ pataki lati gba DNA didara to dara, nitorinaa awọn iwẹ ibẹrẹ ni ifipamọ STE (0.25 M sucrose, 0.03 M Tris, 0.05 M EDTA) ni a ṣe bi a ti ṣalaye nipasẹ [52]. Apapọ DNA ti jade ni atẹle ọna CTAB [53] ati nikẹhin o ṣayẹwo fun didara ati ifọkansi nipasẹ Nano Drop 2000 UV-vis spectrophotometer (ThermoScientific, Waltham, MA, USA) ati 0.8% agarose gel electrophoresis.
SSR onínọmbà
16 EST-SSR awọn akojọpọ alakoko ni idagbasoke nipasẹ [54] ati idanwo tẹlẹ ninu awọn ẹkọ oniruuru jiini nipasẹ [43] ati [44] ati 21 genomic SSR [45-55] A ṣe ayẹwo lati ṣe iṣiro ibamu wọn (Afikun Tabili S4). A ṣe Genotyping ni lilo ọna fifi aami si fluorescent ti ọrọ-aje ninu eyiti a fi iru M13 kun si alakoko SSR siwaju kọọkan [56]. Awọn apopọ PCR ni a pese sile ni iṣesi 20 gL ti o ni: 50 ng ti DNA lapapọ, 0.2 mM ti apopọ dNTP, 1X ti ifipamọ ifura PCR, 0.8 U ti DreamTaq DNA polymerase (Thermo Scientific, Waltham, MA, USA), 0.16 gM ti alakoko yiyipada , 0.032 gM ti alakoko iwaju ti o gbooro sii pẹlu ọna M13 (5'-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′), ati 0.08 gM ti alakoko M13 gbogbo agbaye ti a samisi pẹlu FAM tabi awọn awọ fluorescent NED (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA). Awọn aati PCR ni a ṣe ni SimpliAmp (Applied Biosystems, CA, USA) thermocycler pẹlu awọn ipo wọnyi fun pupọ julọ awọn orisii alakoko: 94 °C fun iṣẹju 5, awọn iyipo 40 ni 94 °C fun 30 s, 58 °C fun 45 s ati 72 °C fun 45 s ati ipari ipari ni 72 °C fun 5 min. Bi fun ACM446 ati ACM449, PCR ifọwọkan kan ni a lo pẹlu annealing ti 60 °C si 55 °C lori awọn iyipo 10, awọn iyipo 30 ni 55 °C, atẹle nipasẹ itẹsiwaju ipari ti 5 min ni 72 °C. Awọn ọja PCR ni a kojọpọ sinu awo 96-daradara ati ki o dapọ pẹlu 14 gL ti Hi-Di Formamide (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) ati 0.5 gL GeneScan 500 ROX Size Standard (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA). A ṣe ipinnu awọn amplicons nipasẹ ọna ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) ẹrọ atele capillary, nibiti a ti gba awọn alleles gẹgẹbi aṣẹ-alakoso ati sọtọ nipasẹ lilo GeneMapper Software Version 3.7.
Awọn sọfitiwia GenAlEx 6.5 [57] ati Cervus 3.0.7 [58] ni a lo lati ṣe iṣiro nọmba awọn alleles (Na), nọmba awọn alleles ti o munadoko (Ne), heterozygosity ti a ṣe akiyesi (Ho), heterozygosity ti a ti ṣe yẹ (He), akoonu alaye polymorphic (PIC), Atọka alaye Shannon (I), ati atọka atunṣe (Fis). ) fun kọọkan SSR agbegbe.
Iṣayẹwo Oniruuru Jiini
Pipin akosori ti iyatọ jiini laarin ati laarin awọn olugbe alubosa ni a ṣe ayẹwo nipasẹ GenAlEx 6.5 [57] nipasẹ igbekale ti iyatọ molikula (AMOVA) pẹlu 999 bootstrapping lati ṣe idanwo fun pataki. Pẹlupẹlu, sọfitiwia GenAlEx 6.5 ni a lo lati ṣe iṣiro oniruuru laarin olugbe kọọkan nipa ṣiṣe iṣiro aropin Ho, He, ati Fis lori gbogbo agbegbe SSR.
Ipilẹ-itumọ ti awọn eniyan ni a ṣe afihan nipasẹ ilana iṣupọ algoridimu ti o da lori awoṣe Bayesian ti a ṣe imuse ninu sọfitiwia STRUCTURE v.2.3.4 [59]. Eto data naa ni a ṣiṣẹ pẹlu nọmba awọn iṣupọ hypothetical (K), ti o wa lati 1 si 10, ṣeto awọn ṣiṣe ominira mẹwa fun iye K kọọkan. Fun ṣiṣe kọọkan, ni ifọkansi lati jẹrisi aitasera ti awọn abajade, akoko sisun ni ibẹrẹ 100,000 ati awọn aṣetunṣe 100,000 Markov Chain Monte Carlo (MCMC) ni a ṣe labẹ awoṣe admixture ati awọn igbohunsafẹfẹ allele ominira laarin awọn olugbe. O ṣeese julọ iye K ni ipinnu imuse ọna AK, ti a ṣalaye nipasẹ [60], ninu eto orisun wẹẹbu HARVESTER STRUCTURE [61]. Olukuluku ẹni kọọkan ni a yàn si iṣupọ kan pato nigbati iye-iye ọmọ ẹgbẹ rẹ ga ju 0.7 lọ, bibẹẹkọ a kà a si ti idile agbapọ.
Ayẹwo ipoidojuko akọkọ ni a ṣe lati le foju inu wo awọn ilana ti ibatan jiini laarin awọn ẹya ti a fihan nipasẹ matrix ijinna jiini Nei (Afikun Tabili S5). Da lori awọn igbohunsafẹfẹ allele, dendrogram kan ti ijinna jiini ni a ṣe ni imuse ọna ẹgbẹ ti ko ni iwuwo pẹlu awọn iṣiro iṣupọ (UPGMA) ninu sọfitiwia POPTREEW [62]. Bootstrapping ni a lo lati ṣe ayẹwo igbẹkẹle ninu ikojọpọ akosoagbasomode, ṣeto iṣatunṣe 100 ti ṣeto data naa. Ni ipari, sọfitiwia MEGA X [63] ti a lo bi igi iyaworan software.
Awọn ohun elo afikun: Awọn atẹle wa lori ayelujara ni http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. Tabili S1: Ẹya ara ẹni ti ARO, MCO, ati TRO bulbs. Tabili S2: Heterozygosity ati awọn itọka imuduro ti a ṣe iṣiro fun awọn ilẹ ilẹ ARO ati awọn ilẹ TRO ati MCO. Tabili S3: Awọn iye meji ti paramita Fpt. Tabili S4: Akojọ ti awọn SSR ti a lo ninu iwadi naa. Tabili S5. Pairwise olugbe matrix ti Nei jiini ijinna. Nọmba S1: Aworan ila ti awọn iye K ti n yipada pẹlu Evanno's Delta K.
Awọn idasile Aṣayan: CL ati LR loyun iwadi naa ati ṣe apẹrẹ idanwo naa; CL ati PI ṣe iṣiro ami ami molikula; ARM ati VZ ṣe awọn idanwo aaye; RM, SP, GR, ati CL ni ipa ninu iṣiro data; RM ati CL kọ iwe afọwọkọ naa. Gbogbo awọn onkọwe ti ka ati gba si ẹya ti a tẹjade ti iwe afọwọkọ naa.
Iṣowo: Iṣẹ yii jẹ agbateru nipasẹ iṣẹ akanṣe Apulian Ekun “Orisirisi Oniruuru ti Eya Ewebe Apulian”—Eto di Sviluppo Rurale per la Puglia 2014-2020. Misura 10-Sottomisura 10.2; fifun CUP H92C15000270002, Italy.
Ifẹmimoorehan: Awọn iyin jẹ nitori "Azienda Agricola Iannone Anna" ati "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva" fun ipese awọn ohun elo ọgbin ti a lo ninu idanwo naa.
Awọn idaniloju Eyiyan: Awọn onkọwe sọ pe ko si ariyanjiyan ti anfani.
jo
- 1. Stearn, WT Awọn eya Allium melo ni a mọ? Kew Mag. 1992, 9, 180-182. [CrossRef]
- 2. FAOSTAT. FAO Statistical aaye data. Wa lori ayelujara: http://www.fao.org/2017 (Wiwọle si ọjọ 8 Oṣu Kini ọdun 2019).
- 3. Àkọsílẹ, E. Kemistri ti ata ilẹ ati alubosa. Sci. Am. 1985, 252, 114-119. [CrossRef]
- 4. Lee, B.; Jung, JH; Kim, Ayẹwo HS ti alubosa pupa lori iṣẹ antioxidant ni eku. Ounjẹ Chem. Toxikol. 2012, 50, 3912-3919. [CrossRef]
- 5. Lee, SM; Oṣupa, J.; Chung, JH; Cha, YJ; Shin, MJ Ipa ti quercetin-ọlọrọ peeli alubosa lori thrombosis iṣan ni awọn eku. Ounjẹ Chem. Toxikol. 2013, 57, 99-105. [CrossRef] [PubMed]
- 6. Yoshinari, O.; Shiojima, Y.; Igarashi, K. Awọn ipa ti o lodi si isanraju ti alubosa jade ni zucker diabetic fatty eku. Awọn ounjẹ 2012, 4,1518-1526. [CrossRef]
- 7. Akash, MSH; Rehman, K.; Chen, S. Ohun ọgbin Spice Allium cepa: Afikun ijẹẹmu fun itọju iru 2 diabetes mellitus. Nutrition 2014, 30, 1128-1137. [CrossRef] [PubMed]
- 8. Wang, Y.; Tian, WX; Ma, XF Awọn ipa Inhibitory ti alubosa (Allium cepa L.) jade lori afikun ti awọn sẹẹli alakan ati adipocytes nipasẹ idinamọ fatty acid synthase. Asian PAC. J. Akàn Prev. 2012,13, 5573-5579. [CrossRef] [PubMed]
- 9. Lai, WW; Hsu, SC; Chueh, FS; Chen, YY; Yang, JS; Lin, JP; Lien, JC; Tsai, CH; Chung, JG Quercetin ṣe idiwọ ijira ati ikọlu ti awọn sẹẹli alakan ẹnu eniyan SAS nipasẹ idinamọ ti NF-kappaB ati matrix metalloproteinase-2/-9 awọn ipa ọna ifihan. Anticancer Res. 2013, 33, 1941-1950. [PubMed]
- 10. Nicastro, HL; Ross, SA; Milner, JA Ata ilẹ ati alubosa: Awọn ohun-ini idena akàn wọn. Akàn Prev. Res. 2015, 8,181-189. [CrossRef]
- 11. Forte, L.; Torricelli, P.; Boanini, E.; Gazzano, M.; Rubini, K.; Fini, M.; Bigi, A. Antioxidant ati awọn ohun-ini atunṣe egungun ti quercetin-functionalized hydroxyapatite: An in vitro osteoblast-osteoclast-endothelial cell co-culture study. Acta Biomater. 2016, 32, 298-308. [CrossRef]
- 12. Yamazaki, Y.; Iwasaki, K.; Mikami, M.; Yagihashi, A. Pipin awọn adun mọkanla, awọn itọsẹ S-Alk (en) yl-L-cysteine , ninu awọn ẹfọ Allium meje. Ounjẹ Sci. Imọ-ẹrọ. Res. 2011, 17, 55-62. [CrossRef]
- 13. Àkọsílẹ, E. Kemistri organosulfur ti Genus Allium-Awọn ohun elo fun kemistri Organic ti sulfur. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1992, 31, 1135-1178. [CrossRef]
- 14. Griffiths, G.; Trueman, L.; Crowther, T.; Thomas, B.; Smith, B. Alubosa-A anfani agbaye si ilera. Phytother. Res. 2002,16, 603-615. [CrossRef]
- 15. Schwimmer, S.; Weston, WJ Enzymatic idagbasoke ti pyruvic acid ni alubosa bi wiwọn ti pungency. J. Agric. Ounjẹ Chem. 1961, 9, 301-304. [CrossRef]
- 16. Ketter, Nran; Randle, WM Pungency igbelewọn ni alubosa. Ninu Idanwo Awọn ẹkọ fun Ẹkọ yàrá; Karcher, SJ, Ed.; Ẹgbẹ fun Ẹkọ Ile-iṣẹ Imọ-iṣe Biology (ABLE): New York, NY, USA, 1998; Iwọn 19, oju-iwe 177-196.
- 17. Hanelt, P Taxonomy, itankalẹ, ati itan. Ninu Alubosa ati Awọn irugbin Allied, Vol. I. Botany, Fisioloji ati Jiini; Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds .; CRC Tẹ: Boca Raton, FL, USA, 1990; ojú ìwé 1-26.
- 18. Rabinowitch, HD; Kúra, L. Imọ irugbin irugbin Allium: Awọn ilọsiwaju to ṣẹṣẹ; CABI Itẹjade: Wallingford, UK, 2002.
- 19. Mallor, C.; Carravedo, M.; Estopanan, G.; Mallor, F. Iwa ti awọn orisun jiini ti alubosa (Allium cepa L.) lati ile-iṣẹ Atẹle ti Ilu Sipeeni ti oniruuru. Igba. J. Agric. Res. 2011, 9, 144-155. [CrossRef]
- 20. Ferioli, F.; D'Antuono, LF Igbelewọn ti phenolics ati cysteine sulfoxides ni agbegbe alubosa ati shallot germplasm lati Italy ati Ukraine. Genet. Ohun elo. Irugbin Evol. 2016, 63, 601-614. [CrossRef]
- 21. Petropoulos, SA; Fernandes, A.; Barros, L.; Ferreira, ICFR; Ntatsi, G. Morphological, ijẹẹmu ati kemikali apejuwe ti 'vatikiotiko', ohun alubosa agbegbe landrace lati Greece. Ounjẹ Chem. 2015,182, 156-163. [CrossRef]
- 22. Liguori, L.; Adiletta, G.; Nazzaro, F.; Fratianni, F.; Di Matteo, M.; Albanese, D. Biochemical, awọn ohun-ini antioxidant ati iṣẹ antimicrobial ti awọn oriṣiriṣi alubosa ti o yatọ ni agbegbe Mẹditarenia. J. Ounjẹ Meas. Iwa. 2019,13, 1232-1241. [CrossRef]
- 23. Yoo, KS; Pike, L.; Crosby, K.; Jones, R.; Leskovar, D. Awọn iyatọ ninu pungency alubosa nitori awọn cultivars, ayika idagbasoke, ati awọn titobi boolubu. Sci. Hortic. 2006,110, 144-149. [CrossRef]
- 24. Beesk, N.; Perner, H.; Schwarz, D.; George, E.; Kroh, LW; Rohn, S. Pipin ti quercetin-3, 4'-O-diglucoside, quercetin-4'-O-monoglucoside, ati quercetin ni awọn ẹya oriṣiriṣi ti boolubu alubosa (Allium cepa L.) ti o ni ipa nipasẹ genotype. Ounjẹ Chem. 2010,122, 566-571. [CrossRef]
- 25. Caruso, G.; Kọnti, S.; Villari, G.; Borrelli, C.; Melchionna, G.; Minutolo, M.; Russo, G.; Amalfitano, C. Awọn ipa ti akoko gbigbe ati iwuwo ọgbin lori ikore, didara ati akoonu antioxidant ti alubosa (Allium cepa L.) ni gusu Italy. Sci. Hortic. 2014,166, 111-120. [CrossRef]
- 26. Perez-Gregorio, MR; Regueiro, J.; Simal-Gandara, J.; Rodrigues, AS; Almeida, DPF Nmu afikun-iye ti alubosa bi orisun ti flavonoids antioxidant: Atunwo to ṣe pataki. Crit. Rev. Ounjẹ Sci. Nutr. 2014, 54,1050-1062. [CrossRef] [PubMed]
- 27. Pohnl, T.; Schweiggert, RM; Carle, R. Ipa ti ọna ogbin ati yiyan cultivar lori awọn carbohydrates ti o yanju ati awọn ilana pungent ninu alubosa. (Allium cepa L.). J. Agric. Ounjẹ Chem. 2018, 66, 12827-12835. [CrossRef] [PubMed]
- 28. Tedesco, I .; Erogba, V.; Spagnuolo, C.; Minasi, P.; Russo, GL Identification ati quantification ti flavonoids lati meji gusu Italian cultivars ti allium cepa L., Tropea (alubosa pupa) ati Montoro (alubosa bàbà), ati agbara wọn lati daabobo awọn erythrocytes eniyan lati aapọn oxidative. J. Agric. Ounjẹ Chem. 2015, 63, 5229-5238. [CrossRef]
- 29. Villano, C.; Esposito, S.; Carucci, F.; Frusciante, L.; Carputo, D.; Aversano, R. Giga-throughput genotyping ni alubosa han be ti jiini oniruuru ati alaye SNPs wulo fun molikula ibisi. Mol. Irubi. 2019, 39, 5. [CrossRef]
- 30. Mercati, F.; Longo, C.; Poma, D.; Araniti, F.; Lupini, A.; Mammano, MM; Fiore, MC; Abenavoli, MR; Sunseri, F Jiini iyatọ ti ẹya Italian gun selifu-aye tomati (Solanum lycopersicum L.) gbigba nipasẹ lilo SSR ati awọn ami eso ti ara. Genet. Ohun elo. Irugbin Evol. 2014, 62, 721-732. [CrossRef]
- 31. Gonzalez-Perez, S.; Mallor, C.; Garces-Claver, A.; Merino, F.; Taboada, A.; Rivera, A.; Pomar, F.; Perovic, D.; Silvar, C. Ṣiṣawari oniruuru jiini ati awọn ami didara ni akojọpọ alubosa (Allium cepa L.) landraces lati ariwa-oorun Spain. Genetics 2015, 47, 885-900. [CrossRef]
- 32. Lotti, C.; Iovieno, P.; Centomani, I.; Marcotrigiano, AR; Fanelli, V.; Mimiola, G.; Summo, C.; Pavan, S.; Ricciardi, L. Genetic, bio-agronomic, ati iwa ijẹẹmu ti kale (Brassica oleracea L. var. acephala) oniruuru ni Apulia, Gusu Italy. Diversity 2018,10, 25. [CrossRef]
- 33. Bardaro, N.; Marcotrigiano, AR; Bracuto, V.; Mazzeo, R.; Ricciardi, F.; Lotti, C.; Pavan, S.; Ricciardi, L. Jiini igbekale ti resistance si Orobanche crenata (Forsk.) ninu ewa (Pisum sativum L.) laini strigolactone kekere. J. Eweko Pathol. 2016, 98, 671-675.
- 34. Wako, T.; Tsukazaki, H.; Yaguchi, S.; Yamashita, K.; Ito, S.; Shigyo, M. Iyaworan ti pipo trait loci fun bolting akoko ni bunching alubosa (Allium fistulosum L.). Euphytica 2016, 209, 537-546. [CrossRef]
- 35. Dhaka, N.; Mukhopadhyay, A.; Paritosh, K.; Gupta, V.; Pental, D.; Pradhan, AK Idanimọ ti awọn SSRs jiini ati ikole maapu asopọ ti o da lori SSR ni Brassica juncea. Euphytica 2017, 213, 15. [CrossRef]
- 36. Anandhan, S .; Mote, SR; Gopal, J. Igbelewọn ti idanimọ iyatọ alubosa nipa lilo awọn ami SSR. Irugbin Sci. Imọ-ẹrọ. 2014, 42, 279-285. [CrossRef]
- 37. Mitrova, K.; Svoboda, P.; Ovesna, J. Aṣayan ati afọwọsi ti aami ti a ṣeto fun iyatọ ti awọn cultivars alubosa lati Czech Republic. Czech J. Genet. Irugbin ọgbin. 2015, 51, 62-67. [CrossRef]
- 38. Di Rienzo, V.; Miazzi, MM; Fanelli, V.; Sabetta, W.; Montemurro, C. Itoju ati isọdi ti Apulian olifi germplasm ipinsiyeleyele. Acta Hortic. 2018,1199,1-6. [CrossRef]
- 39. Mallor, C.; Arnedo-Andres, A.; Garces-Claver, A. Ṣiṣayẹwo oniruuru jiini ti Spani allium cepa landraces fun ibisi alubosa lilo microsatellite asami. Sci. Hortic. 2014,170, 24-31. [CrossRef]
- 40. Rivera, A.; Mallor, C.; Garces-Claver, A.; Garcia-Ulloa, A.; Pomar, F.; Silvar, C. Ṣiṣayẹwo oniruuru jiini ninu alubosa (allium cepa L.) landraces lati ariwa-oorun Spain ati lafiwe pẹlu awọn European iyipada. NZJ Irugbin Hortic. 2016, 44, 103-120. [CrossRef]
- 41. De Giovanni, C .; Pavan, S.; Taranto, F.; Di Rienzo, V.; Miazzi, MM; Marcotrigiano, AR; Mangini, G.; Montemurro, C.; Ricciardi, L.; Lotti, C. Iyipada jiini ti ikojọpọ germplasm agbaye ti chickpea (Cicer arietinum L.) pẹlu Itali accessions ni ewu ti jiini ogbara. Physiol. Mol. Biol. Awọn ohun ọgbin 2017, 23, 197-205. [CrossRef]
- 42. Mazzeo, R.; Morgese, A.; Sonnante, G.; Zuluaga, DL; Pavan, S.; Ricciardi, L.; Lotti, C. Jiini oniruuru ni broccoli rabe (Brassica rapa L. subsp. sylvestris (L.) Janch.) lati Gusu Italy. Sci. Hortic. 2019, 253, 140-146. [CrossRef]
- 43. Jakse, M.; Martin, W.; McCallum, J.; Havey, M. Nikan nucleotide polymorphisms, indels, ati awọn ti o rọrun ọkọọkan ntun fun alubosa cultivar idanimọ. J. Am. Soc. Hortic. Sci. 2005,130, 912-917. [CrossRef]
- 44. McCallum, J.; Thomson, S.; Pither-Joyce, M.; Kenel, F. Onínọmbà oniruuru jiini ati idagbasoke ami-ami polymorphism-nucleotide ni alubosa boolubu ti o gbin ti o da lori itọka ti a fihan-irọrun awọn ami isọdọtun. J. Am. Soc. Hortic. Sci. 2008,133, 810-818. [CrossRef]
- 45. Baldwin, S.; Pither-Joyce, M.; Wright, K.; Chen, L.; McCallum, J. Idagbasoke ti logan genomic o rọrun ọkọọkan tun awọn asami fun iṣiro ti jiini oniruuru laarin ati laarin boolubu alubosa. (Allium cepa L.) awọn olugbe. Mol. Irubi. 2012, 30, 1401-1411. [CrossRef]
- 46. DeWoody, JA; Honeycutt, RL; Skow, LC Microsatellite asami ni funfun tailed agbọnrin. J. Hered. 1995, 86, 317-319. [CrossRef] [PubMed]
- 47. Khodadadi, M.; Hassanpanah, D. Iranian alubosa (Allium cepa L.) cultivars idahun si inbreeding şuga. Agbaye App. Sci. J. 2010,11, 426-428.
- 48. Abdou, R.; Bakasso, Y.; Saadou, M.; Baudoin, JP; Hardy, OJ Jiini oniruuru ti Niger alubosa (Allium cepa L.) ti a ṣe ayẹwo nipasẹ awọn ami isamisi ti o rọrun (SSR). Acta Hortic. 2016,1143, 77-90. [CrossRef]
- 49. Pavan, S.; Lotti, C.; Marcotrigiano, AR; Mazzeo, R.; Bardaro, N.; Bracuto, V.; Ricciardi, F.; Taranto, F.; D'Agostino, N.; Schiavulli, A.; et al. Iṣijọpọ jiini ọtọtọ ni chickpea ti o gbin gẹgẹbi a ti fi han nipasẹ wiwa-ami-ara-jakejado jiini ati jiiniti. Ohun ọgbin Genome 2017, 2017,10. [CrossRef]
- 50. Pavan, S.; Marcotrigiano, AR; Ciani, E.; Mazzeo, R.; Zonno, V.; Ruggieri, V.; Lotti, C.; Ricciardi, L. Genotyping-nipasẹ-tẹle ti melon (Cucumis melo L.) ikojọpọ germplasm lati ile-iṣẹ keji ti oniruuru ṣe afihan awọn ilana ti iyatọ jiini ati awọn ẹya jiini ti awọn adagun-ara pupọ. BMC Genom. 2017, 18, 59. [CrossRef]
- 51. Di Rienzo, V.; Sioni, S.; Taranto, F.; D'Agostino, N.; Montemurro, C.; Fanelli, V.; Sabetta, W.; Boucheffa, S.; Tamendjari, A.; Pasqualone, A.; et al. Ṣiṣan jiini laarin awọn olugbe olifi laarin agbada Mẹditarenia. Ẹlẹgbẹ J. 2018, 6. [CrossRef]
- 52. Oluso-agutan, LD; McLay, TG Awọn ilana iwọn micro-meji fun ipinya ti DNA lati inu ohun ọgbin ọlọrọ polysaccharide. J. Ohun ọgbin Res. 2011,124, 311-314. [CrossRef]
- 53. Doyle, JJ; Doyle, JL Ipinya ti DNA ọgbin lati inu àsopọ titun. idojukọ 1990,12, 13-14.
- 54. Kuhl, JC; Cheung, F.; Qiaoping, Y.; Martin, W.; Zewdie, Y.; McCallum, J.; Catanach, A.; Rutherford, P.; rì, KC; Jenderek, M.; et al. Eto alailẹgbẹ ti alubosa 11,008 ti a ṣe afihan awọn ami ọkọọkan ṣe afihan ọna ti a fihan ati awọn iyatọ jiini laarin awọn aṣẹ monocot asparagales ati awọn poales. Ẹyin ọgbin 2004,16, 114-125. [CrossRef]
- 55. Kim, HJ; Lee, HR; Hyun, JY; Orin, KH; Kim, KH; Kim, JE; Hur, CG; Harn, CH Siṣamisi idagbasoke fun alubosa igbeyewo ti nw jiini lilo SSR Oluwari. Korean J. ajọbi. Sci. 2012, 44, 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. Ohun aje ọna fun Fuluorisenti lebeli ti PCR ajẹkù. Nat. Imọ-ẹrọ. 2000, 18, 233-234. [CrossRef] [PubMed]
- 57. Peakall, R.; Smouse, PE GenAlEx 6.5: Itupalẹ Jiini ni Excel. Sọfitiwia jiini olugbe fun ikọni ati iwadii: imudojuiwọn. Bioinformatics 2012, 28, 2537-2539. [CrossRef] [PubMed]
- 58. Kalinowski, ST; Taper, ML; Marshall, TC Atunyẹwo bawo ni eto kọnputa CERVUS ṣe gba aṣiṣe genotyping ṣe alekun aṣeyọri ninu iṣẹ iyansilẹ baba. Mol. Ekol. 2007,16, 1099-1106. [CrossRef]
- 59. Pritchard, JK; Stephens, M.; Rosenberg, NA; Donnelly, P. Association aworan agbaye ni eleto olugbe. Am. J. Hum. Genet. 2000, 67, 170-181. [CrossRef]
- 60. Evanno, G.; Regnaut, S.; Goudet, J. Wiwa awọn nọmba ti awọn iṣupọ ti awọn ẹni-kọọkan nipa lilo software STRUCTURE: A simulation iwadi. Mol. Ekol. 2005,14, 2611-2620. [CrossRef]
- 61. Etí, D.; VonHoldt, B. IKÚRẸ ẸSẸ: Oju opo wẹẹbu kan ati eto fun wiwo igbejade igbekalẹ ati imuse ọna Evanno. Itoju. Genet. Ohun elo. 2011, 4. [CrossRef]
- 62. Takezaki, N.; Nei, M.; Tamura, K. POPTREEW: Oju opo wẹẹbu ti POPTREE fun kikọ awọn igi olugbe lati data igbohunsafẹfẹ allele ati iṣiro diẹ ninu awọn iwọn miiran. Mol. Biol. Evol. 2014, 31, 1622-1624. [CrossRef]
- 63. Kumar, S.; Stecher, G.; Li, M.; Knyaz, C.; Tamura, K. MEGA X. Onínọmbà Itankalẹ Iyika Imọlẹ Molecular kọja awọn iru ẹrọ iširo. Mol. Biol. Evol. 2018, 35, 1547-1549. [CrossRef]